Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SURF6O75683 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SURF6O75683 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SURF6O75683 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SURF6O75683 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SURF6O75683 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SURF6O75683 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SURF6O75683 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms