Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms