Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms