Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms