Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms