Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRTO14522 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRTO14522 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
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