Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms