Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1E9PL57 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms