Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms