Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMG1C9JSJ3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms