Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms