Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG5

FAM25C, Protein FAM25C, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25CB3EWG5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM25CB3EWG5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25CB3EWG5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms