Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF839A8K0R7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms