Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DBX1A6NMT0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms