Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms