Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms