Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKP3Q9Y446 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms