Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms