Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms