Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms