Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRPF3Q9ULD4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRPF3Q9ULD4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRPF3Q9ULD4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRPF3Q9ULD4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRPF3Q9ULD4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BRPF3Q9ULD4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BRPF3Q9ULD4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BRPF3Q9ULD4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BRPF3Q9ULD4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BRPF3Q9ULD4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BRPF3Q9ULD4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms