Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN1Q9ULB1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms