Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms