Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms