Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms