Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHORDC1Q9UHD1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHORDC1Q9UHD1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHORDC1Q9UHD1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHORDC1Q9UHD1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHORDC1Q9UHD1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHORDC1Q9UHD1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHORDC1Q9UHD1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHORDC1Q9UHD1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHORDC1Q9UHD1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHORDC1Q9UHD1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHORDC1Q9UHD1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHORDC1Q9UHD1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHORDC1Q9UHD1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHORDC1Q9UHD1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CHORDC1Q9UHD1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHORDC1Q9UHD1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHORDC1Q9UHD1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHORDC1Q9UHD1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHORDC1Q9UHD1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms