Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms