Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP2BPQ9P2M1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms