Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms