Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms