Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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SH3BP4Q9P0V3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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SH3BP4Q9P0V3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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SH3BP4Q9P0V3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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SH3BP4Q9P0V3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SH3BP4Q9P0V3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SH3BP4Q9P0V3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SH3BP4Q9P0V3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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SH3BP4Q9P0V3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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