Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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