Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATAD3AQ9NVI7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms