Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCM2LQ9NUG4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCM2LQ9NUG4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms