Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTU7

CBLN4, Cerebellin-4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN4Q9NTU7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN4Q9NTU7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms