Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms