Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A13Q9NSD5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms