Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms