Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPHNQ9NQX3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms