Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MEPEQ9NQ76 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms