Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F12Q9HCS2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms