Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6CQ9HCJ0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms