Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SENP6Q9GZR1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SENP6Q9GZR1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms