Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms