Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms