Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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