Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms