Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms