Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms