Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms